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出國看?。悍伟┲委熜逻M展,利用超算可發(fā)現(xiàn)肺癌繁殖有關(guān)的新RNA藥
【本文為疾病百科知識,僅供閱讀】 2019-08-07 作者:厚樸方舟
日本愛知縣癌癥中心分子診斷轉(zhuǎn)化研究領(lǐng)域(主任:田口步)的主任研究員梶野泰祐與總監(jiān)高橋隆等人組成的研究小組,通過與名古屋大學(xué)(島村徹平教授)和東京大學(xué)醫(yī)科學(xué)研究所(宮野悟教授)等開展聯(lián)合研究,發(fā)現(xiàn)了對于肺癌細胞的繁殖而言極為重要的、且未被翻譯成蛋白質(zhì)的RNA(非編碼RNA)。
基于激酶和轉(zhuǎn)錄因子等蛋白質(zhì)的控制對肺癌細胞的存活和繁殖至關(guān)重要。然而,盡管已經(jīng)知道人類基因組中存在數(shù)萬種相對較長的長鏈非編碼RNA,但其具體的功能幾乎全部未知。距離發(fā)現(xiàn)肺癌患者的MYC基因存在異常已經(jīng)過去30多年,此次研究小組利用超級計算機“京”解析了肺癌腫瘤組織中的基因表達信息,發(fā)現(xiàn)了通過控制典型癌癥基因MYC的表達來維持肺癌細胞繁殖的長鏈非編碼RNA(被命名為MYMLR,見下圖)。
圖:利用超級計算機“京”發(fā)現(xiàn)MYMLR
通過抑制MYMLR,可以顯著減少MYC的表達,從而抑制肺癌細胞的繁殖。因此,有望利用此次的研究成果開發(fā)出以MYMLR為靶向的、對典型的難治性癌癥肺癌也有效的新治療方法。
具體內(nèi)容已于2019年7月30日發(fā)表在歐洲分子生物學(xué)組織(EMBO)的期刊《The EMBO Journal》的網(wǎng)絡(luò)速報版上。
肺癌是日本的靠前大致死癌癥,雖然針對突變型上皮生長因子受體EGFR的分子靶向藥物和免疫檢查點抑制劑等新治療方法在部分肺癌患者身上顯示出了效果,但每年仍造成7萬多人死亡,是典型的難治性癌癥。近年來的基因組研究表明,細胞內(nèi)存在數(shù)萬種類未被翻譯成蛋白質(zhì)、而是直接以RNA的形式發(fā)揮作用的長鏈非編碼RNA。較近還發(fā)現(xiàn),蛋白質(zhì)與長鏈非編碼RNA之間存在復(fù)雜的控制關(guān)系。這表明,這些長鏈非編碼RNA的控制機制失靈可能與細胞癌變密切相關(guān),需要找出在肺癌的發(fā)生和惡化中發(fā)揮重要作用的長鏈非編碼RNA。
研究小組著眼于典型的癌癥基因——肺癌細胞繁殖所必需的轉(zhuǎn)錄因子MYC,探索了控制MYC的長鏈非編碼RNA。利用超級計算機“京”解析肺癌患者腫瘤組織中的基因表達信息,發(fā)現(xiàn)了“MYMLR”。研究小組利用肺癌細胞株調(diào)查了MYMLR的功能,發(fā)現(xiàn)MYMLR是MYC維持表達所必需的RNA,在肺癌細胞的繁殖中發(fā)揮重要作用。為了詳細查明基于MYMLR的MYC控制機制,研究小組探索了與MYMLR聯(lián)動工作的蛋白質(zhì),確定PCBP2是與MYMLR結(jié)合的蛋白質(zhì)。另外還確認,MYMLR通過與PCBP2結(jié)合,會彎曲MYC基因附近的基因組DNA,使負責(zé)控制基因表達的增強子靠近啟動子,由此來控制MYC的轉(zhuǎn)錄。
細胞的繁殖可以通過激酶和轉(zhuǎn)錄因子進行適當(dāng)?shù)目刂疲刂剖ъ`會引起細胞癌變。另一方面,基因組上存在數(shù)萬種長鏈非編碼RNA,但其功能幾乎全部未知。此次明確了作為長鏈非編碼RNA之一的MYMLR在肺癌細胞繁殖中的重要性及其具體功能,因此有望開發(fā)出以MYMLR為靶向的創(chuàng)新治療方法。另外,此次的研究表明,利用基于超級計算機的系統(tǒng)生物學(xué)方法進行探索,能逼近長鏈非編碼RNA與蛋白質(zhì)之間的控制關(guān)系,為查清多達數(shù)萬種的長鏈非編碼RNA的功能開辟了道路。
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