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癌癥遺傳篩選資源庫邁向新臺階,CRISPR-Cas9數(shù)據(jù)集分析更加全面!
【本文為疾病百科知識,僅供閱讀】 2019-12-26 作者:厚樸方舟
在驗證了725種癌癥模型中跨越25種不同癌癥類型的兩個較大的CRISPR-Cas9基因篩選之后,對于癌癥生存所必需的基因的全面圖譜又近了一步?;菘瞪8裱芯克╓ellcomeSangerInstitute)和麻省理工學院和哈佛大學廣泛研究所的科學家比較了這兩個數(shù)據(jù)集的一致性,并獨立地驗證了方法和發(fā)現(xiàn)。
該結果于今天(2019年12月20日)在《自然通訊》上發(fā)表,這意味著可以將這兩個數(shù)據(jù)集整合起來,形成迄今為止較大的癌細胞系遺傳篩選,這將為約1,000種癌癥模型中的癌癥依賴圖提供基礎。該組合數(shù)據(jù)集的規(guī)模將有助于加快新癌癥藥物的發(fā)現(xiàn)和開發(fā)。
癌癥依賴圖(CancerDepMap)計劃旨在為患者創(chuàng)建詳細的準確癌癥治療規(guī)則手冊。癌癥DepMap的兩個關鍵要素是對癌細胞存活至關重要的基因的作圖和所得數(shù)據(jù)集的分析。盡管近日癌癥研究取得了進展,但要使準確醫(yī)學廣泛用于癌癥患者仍需要許多新的藥物靶標。
在這項新研究中,研究人員分析了在Broad和Sanger研究所對癌細胞系進行的兩個近期發(fā)表的CRISPR-Cas9基因篩選的數(shù)據(jù)。盡管實驗方案存在顯著差異,該小組發(fā)現(xiàn)篩選結果彼此一致。至關重要的是,在兩個數(shù)據(jù)集中都發(fā)現(xiàn)了對癌癥生存至關重要的相同基因(稱為依賴性)。
這項研究驗證了CRISPR-Cas9功能基因篩選的可重復性,以消除對其功效的懷疑。它為評估這些新類型的數(shù)據(jù)集設定了嚴格的標準,從而促進了大型癌癥依賴數(shù)據(jù)庫的比較和集成。
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