近日，在《Nature Immunology》雜志上發(fā)表的一項研究論文中提到，麻省理工學院的研究人員設計出一種新方法，可以鑒定具有特定靶標的T細胞。該論文的主要作者是研究生Ang Andy Tu和博士后Todd Gierahn。

通過高通量單細胞RNA測序，能夠確定某一細胞在給定時間的基因表達情況，進而揭示該T細胞的獨特功能。研究人員通過使用這種方法來研究患者的T細胞對花生過敏的特征，進而開發(fā)針對花生過敏的特定治療方法，并確定該治療方法是否對特定患者有效。此類研究還可以指導研究人員開發(fā)和測試其他的新治療方法。

這一新方法建立在先前大量工作開發(fā)的技能基礎上。該技能可以在大量細胞上快速執(zhí)行單細胞RNA測序。通過對信使RNA進行測序，科學家可以發(fā)現(xiàn)在給定時間表達的基因，從而使他們了解單個細胞的功能。

T細胞在免疫反應中具有許多不同的作用。然而，之前的RNA測序研究無法準確發(fā)現(xiàn)對特定靶標或抗原有反應的T細胞群體。這是由T細胞受體(TCR)的序列特征決定的。單細胞RNA測序通常僅標記和測序每個RNA分子的其中一端，而T細胞受體基因的大部分變異都位于序列的另一端，因此常規(guī)的測序手段無法確定T細胞的受體信息。

在單個T細胞中，編碼T細胞受體的RNA不足細胞總RNA的1%，因此MIT小組提出了一種新方法：擴增這些特定RNA分子，然后將其從總樣品中“拉出”。每個RNA分子都標記有條形碼，以揭示其細胞來源信息，因此研究人員可以將T細胞的靶標與其RNA表達方式進行匹配。由此可以確定哪些基因在靶向特定抗原的T細胞群體中具有活性。

“要進一步了解T細胞的功能，就必須了解它們的受體識別的靶點信息。這種方法可以利用現(xiàn)有的單細胞RNA測序文庫，并提取想要表征的相關序列?！毖芯咳藛T說，該技能的另一個優(yōu)點是它不需要使用昂貴的化學試劑，許多實驗室已經(jīng)擁有的設備和先前處理過的樣品就可以完成。

研究人員在論文中說，給小鼠接種了針對人乳頭瘤病毒的疫苗后，可以使用該方法篩選出對該病毒產(chǎn)生活性反應的小鼠T細胞。他們發(fā)現(xiàn)，盡管所有T細胞都對病毒起反應，但這些細胞卻有不同的TCR，并且處于不同的發(fā)育階段：一部分T細胞被激活，并殺死被感染的細胞，而另一些則專注于生長和分裂。

然后，研究人員分析了四名對花生過敏患者的T細胞。將細胞暴露于花生過敏原后，他們能夠鑒定出對過敏原具有活性的T細胞，同時還顯示出T細胞的哪些亞群是較為活躍的，并發(fā)現(xiàn)了一些與過敏反應有關的炎性細胞因子。

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